首先要了解DNA鉴定机构的资质，鉴定机构是否经过司法机关的审批，是否具有法医物证鉴定(DNA鉴定)的资质？如果没有这个资质，当然不能作鉴定，更不可能对鉴定负有法律责任。
其次，根据全国人民代表大会常务委员会2005年2月28日出台的《全国人民代表大会常务委员会关于司法鉴定管理问题的决定》，这些从事司法鉴定的实验室必须强制性地通过实验室认可或计量认证。因为实验室认可有一套完整的实验室管理和技术流程体系，以确保检测结果准确和可靠，只有通过了实验室认可．无论是国家还是国际才能承认这个实验室的检测结果。因此，一定要选择那些通过了实验室认可或计量认证的机构，同时还要注意这个实验室认可的是不是DNA鉴定这一项，有的实验室也通过了计量认证或实验室认可，但可能是其他项目通过的，而不是DNA鉴定这个项目通过的，这些都需要注意。
鉴定机构是否有几套试剂盒备用？鉴定机构是否跟被鉴定人签订合同，明确双方的责任和义务都可以作为辨别其资质优劣的参照。
曾经有过一次问卷调查表明大家对DNA亲子鉴定的要求，最重要的就是准确，其次是保密。这两点是大家最关注的。
因此，在选择鉴定机构的时候应该选择在业内有一定知名度的鉴定机构。鉴定机构所做过的案例越多，经验就越丰富，程序上也越规范，程序上不出错，结论就准确，这是进入诉讼案件的基本要求。
有的人可能出于保密的考虑，会找一些比较隐蔽的小的不起眼的地方去做鉴定，但是这种鉴定如果出任何问题，对一个家庭将是毁灭性的打击，因此，一定要选择鉴定结果可信的鉴定中心，不能光顾及私密性而忽略了对鉴定中心资质等的考察，以至得到一个不实的结论，影响家庭关系，甚至导致家庭关系的解体。
